259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2631 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2631  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
352 aa  627  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.774949  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  36.49 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  33.46 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  34.47 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
385 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  34 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
383 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1573  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 
410 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0878  major facilitator transporter  32.98 
 
 
401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  27.53 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  34.25 
 
 
383 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  38.87 
 
 
400 aa  112  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 
396 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  34.6 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  36.34 
 
 
441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  33.24 
 
 
403 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 
389 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 
381 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 
397 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  32.02 
 
 
417 aa  106  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  35.2 
 
 
396 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  33.52 
 
 
384 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  34.35 
 
 
384 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
387 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
405 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 
408 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 
389 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
388 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  36.25 
 
 
388 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  33.14 
 
 
386 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  34.41 
 
 
388 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  38.48 
 
 
403 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0218  major facilitator transporter  33.43 
 
 
369 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.851402  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
387 aa  103  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 
470 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  33.33 
 
 
377 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  32.85 
 
 
400 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 
373 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  35.76 
 
 
385 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  32.48 
 
 
385 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  30.11 
 
 
411 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  37.07 
 
 
393 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  33.54 
 
 
384 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  33.54 
 
 
384 aa  100  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  33.54 
 
 
384 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  32.12 
 
 
378 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  32.12 
 
 
378 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
465 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  32.12 
 
 
378 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  32.12 
 
 
378 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  32.12 
 
 
378 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  32.12 
 
 
378 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  30.55 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  30.7 
 
 
409 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  32.42 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  32.8 
 
 
389 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
387 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
386 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  36.76 
 
 
392 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
402 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  30.29 
 
 
404 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  30.29 
 
 
404 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  28.94 
 
 
396 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  31.82 
 
 
378 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  33.43 
 
 
405 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  33.53 
 
 
408 aa  96.3  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
390 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  31.51 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  31.51 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  32.65 
 
 
414 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  26.02 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  31.21 
 
 
383 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  33 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.75 
 
 
451 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  33.23 
 
 
405 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
398 aa  93.6  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
403 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
391 aa  93.2  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.66 
 
 
402 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 
402 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 
402 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 
402 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  31.15 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.36 
 
 
372 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  30.46 
 
 
392 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 
402 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 
402 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  30.51 
 
 
419 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
413 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  32.67 
 
 
396 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 
392 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  31.07 
 
 
443 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  32.05 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>