170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1573 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1573  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  793    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  45.03 
 
 		 374 aa  285  7e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0878  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2631  twin-arginine translocation pathway signal  34.04 
 
 		 352 aa  113  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.774949  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  31.91 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 386 aa  99.8  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  29.61 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  27.15 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  28.62 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  27.9 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  28.29 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  28.16 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  29.96 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  33.45 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  27.3 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  24.84 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3369  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  27.09 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0218  major facilitator transporter  30.74 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.851402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  24.53 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  25.82 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  22.92 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  24.14 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  25 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  24.7 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  25.45 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  26.85 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 382 aa  57  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 396 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 470 aa  56.2  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  21.66 
 
 		 465 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  26.59 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  23.93 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 430 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 415 aa  53.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  24.28 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  24.28 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  24.28 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  24.28 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  24.28 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  24.91 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  23.47 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  26.86 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  22.79 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>