249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3689 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  100 
 
 		 395 aa  778    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  25.65 
 
 		 433 aa  94  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  23.9 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  22.99 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  23.15 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  24.19 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  25.91 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  26.21 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  25 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  23.48 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  22.67 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  25.91 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  24.62 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  24.62 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  24.62 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  24.62 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  24.62 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  23.76 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.745622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  24.53 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  24.53 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  29.35 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  31.51 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  22.02 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  22.02 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  28.63 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  28.9 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  26.04 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  24.81 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  24.55 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  21.14 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59269  predicted protein  22.1 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  26.13 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  23.15 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  23.76 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  22.22 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  23.53 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  31.4 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1573  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2502  hypothetical protein  24.06 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.156303  hitchhiker  0.000706101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  22.25 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  28.49 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  23.31 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  22.17 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  21.55 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  23.54 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  30.12 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1959  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0139885  hitchhiker  0.0025051 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  28.82 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  22.99 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4653  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  22.98 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  24.71 
 
 		 415 aa  57  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  24.71 
 
 		 415 aa  57  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  21.65 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7075  major facilitator family transporter  23.48 
 
 		 370 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  20.27 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  23.54 
 
 		 415 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  25.6 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 326 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  21.94 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8922  Arabinose efflux permease-like protein  26.44 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3272  hypothetical protein  23.55 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  23.1 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  23.81 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  25.29 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  20.94 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  25 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  26.07 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  27.41 
 
 		 408 aa  53.5  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  25.24 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  21.05 
 
 		 441 aa  53.1  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1839  hypothetical protein  25.3 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157174  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>