26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0040 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0040  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  820    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2712  major facilitator transporter  73.63 
 
 		 417 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0893626  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3127  transport protein  37.27 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1636  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 480 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1706  signal peptide and transmembrane prediction  32.79 
 
 		 400 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.873275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 		 426 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0364  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0723  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3437  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5059  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2019  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 556 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  25.64 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3820  General substrate transporter  33.33 
 
 		 600 aa  46.6  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  21.83 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 464 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2181  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2198  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5896  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193247  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1837  fucose permease  24.28 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0765737  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1091  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 455 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.768657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5498  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 455 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>