More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80454 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_80454  myo-inositol transporter  100 
 
 
522 aa  1047    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.806803  normal  0.231524 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08912  myo-inositol transporter (AFU_orthologue; AFUA_2G07910)  39.54 
 
 
528 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04316  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06080)  40.76 
 
 
517 aa  369  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38765  normal  0.214777 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00880  ITR1, putative  42.91 
 
 
567 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02465  hypothetical protein  40.09 
 
 
792 aa  342  9e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03060  myo-inositol transporter, putative  34.72 
 
 
567 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03420  myo-inositol transporter 1, putative  35.38 
 
 
587 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00450  myo-inositol transporter 1, putative  32.82 
 
 
586 aa  294  2e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00990  myo-inositol transporter 2, putative  33 
 
 
590 aa  292  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02980  myo-inositol transporter 2, putative  32.82 
 
 
611 aa  290  6e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715916  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00070  myo-inositol transporter, putative  33.4 
 
 
590 aa  283  5.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00020  myo-inositol transporter, putative  31.24 
 
 
545 aa  276  5e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  33.69 
 
 
477 aa  231  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  33.54 
 
 
452 aa  229  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  32.17 
 
 
480 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  30.74 
 
 
492 aa  223  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06669  Putative sugar transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AYG1]  30.04 
 
 
534 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000679135  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  29.39 
 
 
533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08737  MSTA protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J220]  29.16 
 
 
527 aa  206  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.187861  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  29.66 
 
 
476 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  32.06 
 
 
472 aa  203  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27361  predicted protein  28.41 
 
 
655 aa  203  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114186  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  31.85 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  31.85 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  31.85 
 
 
472 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  31.85 
 
 
472 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  31.85 
 
 
472 aa  201  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  31.85 
 
 
472 aa  201  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  31.85 
 
 
472 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  31.65 
 
 
472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  30.11 
 
 
499 aa  196  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  30.62 
 
 
464 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  30.62 
 
 
464 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  30.62 
 
 
464 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  30.62 
 
 
464 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  31.12 
 
 
472 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  30.62 
 
 
464 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  30.85 
 
 
472 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  30.85 
 
 
472 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  30.85 
 
 
472 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  30.85 
 
 
472 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  30.36 
 
 
472 aa  194  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  28.92 
 
 
468 aa  194  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  30.08 
 
 
480 aa  193  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  29.98 
 
 
464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  30.13 
 
 
465 aa  189  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  29.76 
 
 
464 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  29.7 
 
 
448 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  29.76 
 
 
464 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  29.76 
 
 
464 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  29.76 
 
 
464 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  29.76 
 
 
464 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00540  galactose transporter, putative  29.06 
 
 
550 aa  189  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  29.76 
 
 
464 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  29.76 
 
 
464 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  29.52 
 
 
480 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  29.76 
 
 
464 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  29.75 
 
 
468 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  31.97 
 
 
458 aa  186  8e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  29.21 
 
 
471 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  29.07 
 
 
472 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  29.1 
 
 
474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  27.29 
 
 
466 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  28.74 
 
 
482 aa  183  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  29.61 
 
 
507 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  28.19 
 
 
463 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  28.19 
 
 
463 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  28.28 
 
 
497 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  30.15 
 
 
447 aa  182  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  30.33 
 
 
468 aa  180  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1619  hypothetical protein  28.94 
 
 
471 aa  180  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  30.13 
 
 
475 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  29.4 
 
 
449 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  29.57 
 
 
446 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  30.6 
 
 
482 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  30.8 
 
 
516 aa  177  6e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1624  hypothetical protein  27.86 
 
 
471 aa  177  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85501  High-affinity glucose transporter  26.33 
 
 
747 aa  176  7e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0464607  normal  0.964846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  31.65 
 
 
480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47769  predicted protein  26.6 
 
 
522 aa  174  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2375  sugar transporter  30.85 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00427288  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  29.54 
 
 
442 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64741  sugar transporter protein  29.19 
 
 
550 aa  173  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402333  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_27983  Sugar UpTake (tentative)  29.48 
 
 
550 aa  173  6.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.180127  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_27984  Sugar UpTake (tentative)  29.48 
 
 
550 aa  173  7.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04277  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  27.73 
 
 
584 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.851042  normal  0.103558 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66414  hexose transporter  28.74 
 
 
553 aa  172  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.730098  normal  0.0488082 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00250  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14442)  27.07 
 
 
547 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  28.42 
 
 
452 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  28.42 
 
 
452 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02420  receptor, putative  27.54 
 
 
550 aa  172  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.915792  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  30.63 
 
 
485 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  30.32 
 
 
486 aa  170  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  27.59 
 
 
480 aa  169  8e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  28.97 
 
 
484 aa  169  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  27.87 
 
 
590 aa  169  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03400  hexose transport-related protein, putative  28.17 
 
 
535 aa  169  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  27.68 
 
 
544 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  29 
 
 
457 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  30.17 
 
 
459 aa  167  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>