23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2019 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2019  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 556 aa  1109    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3127  transport protein  31.36 
 
 		 421 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2712  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0893626  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0364  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 415 aa  156  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1706  signal peptide and transmembrane prediction  28.71 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.873275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0040  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0723  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1636  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3437  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 416 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5059  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 421 aa  53.5  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  25.74 
 
 		 421 aa  48.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 438 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 385 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  27.87 
 
 		 397 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 435 aa  45.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 473 aa  44.3  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 475 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 475 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 475 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>