32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3127 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3127  transport protein  100 
 
 		 421 aa  846    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  49.4 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1706  signal peptide and transmembrane prediction  44.82 
 
 		 400 aa  355  7.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.873275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0364  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 415 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0723  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3437  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5059  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 411 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1636  major facilitator transporter  39.23 
 
 		 480 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2712  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 417 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0893626  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0040  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 411 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2019  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 556 aa  182  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  22.22 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  26.28 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1837  fucose permease  24.05 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0765737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3820  General substrate transporter  31.37 
 
 		 600 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  25.11 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  31.53 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  25 
 
 		 406 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 427 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  31.86 
 
 		 458 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  21.66 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  31.86 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  31.86 
 
 		 446 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  31.86 
 
 		 446 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 384 aa  43.5  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  31.86 
 
 		 458 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  31.86 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.29 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  31.86 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  27.21 
 
 		 429 aa  43.1  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>