More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00677 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  100 
 
 		 405 aa  813    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  71.22 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  51.65 
 
 		 406 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  52.41 
 
 		 406 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  52.66 
 
 		 406 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  51.75 
 
 		 406 aa  359  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  51.5 
 
 		 406 aa  358  7e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  51.5 
 
 		 406 aa  358  7e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  52.41 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 415 aa  356  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  52.15 
 
 		 406 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  46.12 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 421 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  27.43 
 
 		 415 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 415 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  23.67 
 
 		 420 aa  116  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  25.92 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  25.92 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  25.92 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  25.92 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  25.92 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  25.67 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  25.56 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  23.93 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0306  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.338859  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  27.86 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  25.32 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  25.32 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  25.32 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  24.43 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  25.32 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  25.32 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  26.33 
 
 		 409 aa  67  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  21.99 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3243  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.12624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  28.23 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  21.99 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.37 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  28.23 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  23.24 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  22.38 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  21.99 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  21.93 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.24 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.34 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.34 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  23.74 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  23.43 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22.86 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  23.74 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22.86 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  23.43 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0384  bicyclomycin resistance protein  24.34 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  24.93 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  23.44 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  23.73 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  23.44 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  25.55 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  22.66 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  24.17 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  21.45 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 452 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  21.17 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 432 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2271  hypothetical protein  23.68 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2193  inner membrane transport protein YdhC  27.87 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.230534  hitchhiker  0.00000667038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  24.01 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  23.51 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  21.55 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  23 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.13 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0750  fucose permease  25.19 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000880356  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  28.41 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  23.59 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>