101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1346 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 385 aa  746    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2340  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 417 aa  217  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0861  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.605059 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.61 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  23.21 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  23.21 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 391 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  23.83 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  22.98 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.49 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  23.44 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0723  major facilitator transporter  22.6 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  21.16 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  22.12 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  20 
 
 		 398 aa  52.8  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2712  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0893626  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  20.93 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  23.99 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  21.1 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 504 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 488 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 406 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  23.32 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.02 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  26.67 
 
 		 456 aa  50.4  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 462 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 390 aa  50.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  22.12 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2019  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 556 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  24.83 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 493 aa  48.1  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3442  major facilitator superfamily (MFS) transporter  26.9 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1316  major facilitator transporter  20.82 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 489 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.87 
 
 		 440 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3218  major facilitator transporter  29 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0040  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  23.97 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  22.5 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  22.5 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.7 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0364  major facilitator transporter  21.86 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.41 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 512 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  20.72 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  22 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.21 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3437  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  20 
 
 		 379 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.92 
 
 		 490 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04823  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  25.27 
 
 		 479 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05653  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  25.27 
 
 		 479 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.57 
 
 		 459 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.21 
 
 		 474 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 555 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  25.84 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 470 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  25.84 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  23.39 
 
 		 416 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 462 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 524 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.04 
 
 		 545 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 430 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3297  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 477 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  20.92 
 
 		 426 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  32.22 
 
 		 462 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 512 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 512 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 512 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 512 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.15 
 
 		 474 aa  43.1  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1706  signal peptide and transmembrane prediction  22.02 
 
 		 400 aa  42.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.873275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 512 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3791  hypothetical protein  19.51 
 
 		 394 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  25.84 
 
 		 403 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  25.84 
 
 		 403 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3830  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  23.19 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.84 
 
 		 474 aa  42.7  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>