More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3218 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3218  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  795    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  36.32 
 
 		 454 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.66 
 
 		 478 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.66 
 
 		 484 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.66 
 
 		 478 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.38 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 476 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.23 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.14 
 
 		 521 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.04 
 
 		 498 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  33.12 
 
 		 683 aa  81.6  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.96 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.2 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2962  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.73 
 
 		 543 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 502 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.96 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  35.58 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 574 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.34 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.76 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.49 
 
 		 541 aa  76.3  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.35 
 
 		 545 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2971  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 445 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.74 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 520 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 520 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.74 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 523 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.41 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.78 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.74 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.93 
 
 		 613 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.74 
 
 		 520 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.21 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.74 
 
 		 520 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2508  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 527 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  35.14 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1875  multidrug resistance protein B  29.35 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 527 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.7 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  35.14 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  35.14 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  35.14 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.22 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.22 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  35.14 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  35.14 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 512 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.22 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  35.14 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.35 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.81 
 
 		 523 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.81 
 
 		 523 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 		 543 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 		 506 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 		 506 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.27 
 
 		 506 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1374  multidrug resistance protein B  31.52 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.394355  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 512 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.9 
 
 		 520 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 		 508 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1065 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.86 
 
 		 505 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  30.68 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.46 
 
 		 527 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.87 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.73 
 
 		 502 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.82 
 
 		 508 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
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NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 522 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_4414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.72 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  31.29 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.67 
 
 		 627 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
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NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1628  major facilitator superfamily permease  32.99 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.26 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.87 
 
 		 520 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 		 480 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.63 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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