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for query gene LACR_1628 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



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Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1628  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 457 aa  900    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0963  major facilitator superfamily permease  40.55 
 
 		 449 aa  340  2e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.337437  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0290  major facilitator superfamily permease  36.95 
 
 		 463 aa  272  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.146864  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  35.73 
 
 		 471 aa  270  2.9999999999999997e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0280  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040332  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.62 
 
 		 485 aa  263  4e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  32.75 
 
 		 464 aa  262  8e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0360  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 461 aa  247  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1471  major facilitator superfamily permease  39.8 
 
 		 454 aa  246  8e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00462633  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0049  sugar efflux permease  36.38 
 
 		 485 aa  245  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0937  major facilitator superfamily permease  36.65 
 
 		 463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.343736  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0456  major facilitator superfamily permease  32.45 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1088  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.79 
 
 		 446 aa  223  8e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.39 
 
 		 496 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  32.92 
 
 		 480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1003  lincomycin resistance protein LmrB  32.68 
 
 		 480 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2001  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.23 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.54 
 
 		 487 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.62 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  30.24 
 
 		 496 aa  186  5e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 579 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 		 483 aa  186  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 		 489 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.38 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.38 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.74 
 
 		 500 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.71 
 
 		 658 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.59 
 
 		 599 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  31.58 
 
 		 482 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.58 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  30.92 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  30.86 
 
 		 465 aa  180  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.85 
 
 		 492 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  29.85 
 
 		 492 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.59 
 
 		 513 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2756  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29 
 
 		 492 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.1 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.77 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.1 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.35 
 
 		 599 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.59 
 
 		 513 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.16 
 
 		 570 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.59 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.47 
 
 		 640 aa  176  7e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.44 
 
 		 564 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  27.95 
 
 		 683 aa  176  9e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  29.34 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.12 
 
 		 599 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1115  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.87 
 
 		 491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.87 
 
 		 597 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.12 
 
 		 599 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 		 561 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.4 
 
 		 599 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  32.65 
 
 		 599 aa  173  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  31.87 
 
 		 599 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.4 
 
 		 599 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1028  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.13 
 
 		 491 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10576e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.4 
 
 		 599 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.17 
 
 		 491 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 		 494 aa  172  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.42 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1468  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.24 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.986472  normal  0.151461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 		 491 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.7 
 
 		 635 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.96 
 
 		 643 aa  166  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.96 
 
 		 643 aa  166  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1383  major facilitator superfamily permease  29.48 
 
 		 519 aa  164  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.601618  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  27.47 
 
 		 490 aa  163  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.54 
 
 		 492 aa  161  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  28.18 
 
 		 542 aa  160  4e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 481 aa  159  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 481 aa  159  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.16 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.66 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  29.98 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.25 
 
 		 490 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.36 
 
 		 534 aa  156  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 		 484 aa  156  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.06 
 
 		 505 aa  156  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 499 aa  154  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
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NC_010625  Bphy_6615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.28 
 
 		 501 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5520  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.57 
 
 		 502 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_1298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.7 
 
 		 500 aa  151  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000893352  hitchhiker  0.00471574 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.86 
 
 		 620 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.7 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.13 
 
 		 657 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 		 545 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  26.49 
 
 		 484 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
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NC_013165  Shel_23660  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.89 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.629317  normal  0.503051 
 
 
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NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.97 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4865  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.2 
 
 		 473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.09 
 
 		 528 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010678  Rpic_4128  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.09 
 
 		 490 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422777  normal  0.15166 
 
 
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