76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0551 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  82.62 
 
 		 397 aa  669    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  797    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  72.7 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  70.66 
 
 		 394 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  70.66 
 
 		 394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  71.88 
 
 		 380 aa  553  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0348  major facilitator superfamily MFS_1  66.75 
 
 		 393 aa  528  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4675  hypothetical protein  67.01 
 
 		 393 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.398829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  67.26 
 
 		 393 aa  530  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0348  hypothetical protein  67.01 
 
 		 393 aa  528  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3833  hypothetical protein  66.75 
 
 		 393 aa  528  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3560  hypothetical protein  67.01 
 
 		 393 aa  528  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3740  hypothetical protein  66.75 
 
 		 393 aa  526  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3791  hypothetical protein  66.83 
 
 		 394 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03215  hypothetical protein  66.75 
 
 		 393 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03167  hypothetical protein  66.75 
 
 		 393 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  66.24 
 
 		 393 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  66.24 
 
 		 393 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3778  hypothetical protein  65.98 
 
 		 393 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.974681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  65.98 
 
 		 393 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  65.98 
 
 		 393 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2271  hypothetical protein  61.27 
 
 		 393 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2681  hypothetical protein  24.37 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  hitchhiker  0.00146512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3272  hypothetical protein  23.04 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3423  hypothetical protein  23.35 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2502  hypothetical protein  22.66 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.156303  hitchhiker  0.000706101 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1839  hypothetical protein  24.25 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157174  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1658  hypothetical protein  21.94 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0600351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2718  hypothetical protein  21.94 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3785  hypothetical protein  21.98 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  22.99 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  22.99 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  22.99 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  22.99 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  22.99 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  20.27 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  23.58 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1907  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  24.66 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  24.66 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  24.66 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.197436 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  22.6 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  21.83 
 
 		 393 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  21.03 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  21.03 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  21.81 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  20.66 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  20.66 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2184  permease  20.48 
 
 		 422 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  24.27 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  25.37 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 480 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1452  hypothetical protein  29.17 
 
 		 604 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0040  major facilitator transporter  21.83 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  24.89 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.74 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  27 
 
 		 408 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0066  major facilitator superfamily permease  21.17 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.110022  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  23.86 
 
 		 415 aa  43.1  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  23.01 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 426 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01910  arabinose efflux permease family protein  26.43 
 
 		 435 aa  43.1  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>