238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0033 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 409 aa  800    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1679  major facilitator superfamily MFS_1  43.52 
 
 		 396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0241  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0694015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1703  hypothetical protein  31.18 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1642  major facilitator superfamily transporter  32.12 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.511036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  21.25 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  24.33 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.07 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  23.86 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1455  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  21.08 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  22.51 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  22.51 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 460 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  22.51 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 390 aa  53.9  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.26 
 
 		 460 aa  53.9  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  25.61 
 
 		 429 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2340  major facilitator superfamily MFS_1  22.17 
 
 		 417 aa  53.5  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  24 
 
 		 442 aa  53.1  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 451 aa  53.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  22.01 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  22.55 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  25 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  22.52 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  23.04 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  31.62 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 437 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.54 
 
 		 545 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  22.9 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 411 aa  50.4  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  21.6 
 
 		 418 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.42 
 
 		 446 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 446 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 413 aa  49.7  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1541  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0291069  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2018  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.858513  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38823  MFS family transporter: phosphate/sugar  23.39 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.726317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  30.59 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.04 
 
 		 517 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 630 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  22.99 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  25 
 
 		 430 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  21.84 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 522 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 430 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 		 219 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>