More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2381 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 434 aa  869    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  68.01 
 
 		 431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  56.29 
 
 		 438 aa  497  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  63.02 
 
 		 436 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  50.35 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  51.28 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  49.4 
 
 		 441 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  51.51 
 
 		 440 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  51.51 
 
 		 440 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 441 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  46.45 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 441 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 441 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 441 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 433 aa  326  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  49.48 
 
 		 437 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  48.61 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  48.61 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  48.61 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  48.61 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  48.61 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  48.61 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  48.61 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  46.38 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  38.89 
 
 		 494 aa  281  1e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  36.58 
 
 		 442 aa  265  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  40.98 
 
 		 478 aa  263  4.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  39.51 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  36.07 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  28.45 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  29.96 
 
 		 488 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 500 aa  169  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  31.55 
 
 		 439 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  25.54 
 
 		 491 aa  157  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  27.25 
 
 		 501 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  40.1 
 
 		 493 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 488 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 503 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  37.61 
 
 		 489 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  36.73 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  32.32 
 
 		 489 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  35.81 
 
 		 488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  36.45 
 
 		 489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  34.48 
 
 		 488 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  35.6 
 
 		 502 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  33.01 
 
 		 496 aa  123  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  43.12 
 
 		 216 aa  123  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  35.09 
 
 		 507 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  27.49 
 
 		 513 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  31.53 
 
 		 525 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  32 
 
 		 513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  32.51 
 
 		 491 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  31.08 
 
 		 534 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  31.08 
 
 		 533 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  26.96 
 
 		 403 aa  118  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 491 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  33.48 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 502 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  28.26 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  26.56 
 
 		 895 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  26.18 
 
 		 912 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  28.52 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  28.15 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 504 aa  100  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  26.39 
 
 		 493 aa  99.8  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  26.9 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  26.1 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  27.08 
 
 		 422 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  26.15 
 
 		 403 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 453 aa  96.7  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  25.55 
 
 		 387 aa  96.3  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 442 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  25.45 
 
 		 905 aa  94.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  27.64 
 
 		 424 aa  93.6  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 421 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  26.22 
 
 		 403 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 421 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  25.19 
 
 		 426 aa  93.2  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  27 
 
 		 414 aa  93.2  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  25.13 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.13 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 435 aa  90.5  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 404 aa  89.7  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  25 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>