More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0662 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  100 
 
 		 504 aa  1018    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  68.5 
 
 		 501 aa  709    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  86.38 
 
 		 493 aa  882    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  65.39 
 
 		 502 aa  641    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  46.56 
 
 		 488 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  47.18 
 
 		 502 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  45.65 
 
 		 525 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  48.21 
 
 		 488 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  46.85 
 
 		 489 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  46.74 
 
 		 488 aa  421  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  45.68 
 
 		 488 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  45.07 
 
 		 488 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  43.72 
 
 		 493 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  47.02 
 
 		 490 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  44.87 
 
 		 534 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  44.92 
 
 		 533 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  44 
 
 		 489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  44.87 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  45.38 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  45.18 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 500 aa  402  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  44.87 
 
 		 489 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  45.8 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  44.63 
 
 		 491 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  36.07 
 
 		 496 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 451 aa  153  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 436 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  32.54 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  29.38 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  38.76 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  25.38 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 439 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  31.35 
 
 		 441 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  31.35 
 
 		 441 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  31.35 
 
 		 441 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  31.35 
 
 		 441 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  25.45 
 
 		 497 aa  103  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  30.88 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  30.88 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  30.88 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  26.76 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 433 aa  101  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  37.13 
 
 		 441 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 441 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 441 aa  97.1  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 441 aa  97.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 441 aa  96.7  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  25.91 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 434 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  35.29 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  36.3 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  24.41 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  27.51 
 
 		 526 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  24.68 
 
 		 912 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  30.18 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  27.31 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  27.15 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  27.15 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  25 
 
 		 895 aa  69.3  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  28.21 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  25.94 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.94 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  35.38 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  26.96 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  26.96 
 
 		 389 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  26.96 
 
 		 389 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 423 aa  67  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  27.14 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  27 
 
 		 424 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  25.94 
 
 		 426 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  26.47 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  26.47 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  26.47 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  28.16 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  26.47 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>