240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_26029 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  86.74 
 
 		 471 aa  798    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  100 
 
 		 478 aa  979    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  55.81 
 
 		 442 aa  517  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  49.08 
 
 		 526 aa  388  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  45.89 
 
 		 439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  41.77 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  42.9 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  37.53 
 
 		 494 aa  293  5e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 		 458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  40.98 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  39.24 
 
 		 437 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  36.69 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 441 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  38.57 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  38.57 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 441 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 441 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 441 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  31.86 
 
 		 497 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  58.01 
 
 		 216 aa  204  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  35.32 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  29.96 
 
 		 507 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  37.13 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  37.13 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  37.13 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  37.13 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  37.13 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  37.13 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  37.13 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  28.35 
 
 		 493 aa  154  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  28.11 
 
 		 489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  26.11 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  26.58 
 
 		 534 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  26.58 
 
 		 533 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  26.91 
 
 		 490 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 500 aa  123  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 503 aa  117  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  33.02 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  32.89 
 
 		 488 aa  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  30.84 
 
 		 489 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 488 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 442 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  32.16 
 
 		 488 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  31.72 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  31.36 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  29.55 
 
 		 491 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  29.91 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  31 
 
 		 496 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  27.23 
 
 		 525 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 502 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  30.09 
 
 		 513 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  30.95 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  29.65 
 
 		 513 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  28.74 
 
 		 493 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 444 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  23.96 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  24.39 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  22.84 
 
 		 912 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  22.22 
 
 		 895 aa  78.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  25 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  25 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  22.95 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  22.95 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  24.37 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  25.54 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  24.3 
 
 		 422 aa  69.7  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  22.95 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  23.3 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  21.86 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  21.7 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  25.94 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  22.43 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  22.35 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 472 aa  67  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  22.82 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>