More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5402 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 431 aa  864    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  68.01 
 
 		 434 aa  559  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  65.03 
 
 		 436 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  55.43 
 
 		 438 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  52.48 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  50.7 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  47.53 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  50.59 
 
 		 440 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  50.59 
 
 		 440 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  48.33 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 441 aa  342  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 433 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  46.64 
 
 		 441 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  46.64 
 
 		 441 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  46.64 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  46.64 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  48.24 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  46.4 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  46.87 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  49.86 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  50 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  50 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  50 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  49.86 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  49.86 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  50 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  47.99 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  38.64 
 
 		 494 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  41.09 
 
 		 478 aa  269  5.9999999999999995e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  35.01 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  40.62 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  33.57 
 
 		 526 aa  226  5.0000000000000005e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  29.66 
 
 		 497 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  30.22 
 
 		 488 aa  179  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  30.08 
 
 		 488 aa  176  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  32.43 
 
 		 439 aa  163  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  28.25 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  28.42 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  26.01 
 
 		 501 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  28.49 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 500 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  27.46 
 
 		 533 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  27.18 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  39.9 
 
 		 488 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  40.2 
 
 		 489 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  37.81 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  30.61 
 
 		 513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  35.64 
 
 		 496 aa  136  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  29.85 
 
 		 513 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  34.38 
 
 		 525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  36.36 
 
 		 502 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  33.99 
 
 		 489 aa  131  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  35.75 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  33.5 
 
 		 491 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  36.28 
 
 		 507 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  23.44 
 
 		 493 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  41.18 
 
 		 216 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  28.09 
 
 		 895 aa  110  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  29.86 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  27.58 
 
 		 912 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  30.31 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 444 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  29.15 
 
 		 422 aa  99.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  29.97 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  29.75 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  29.33 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 442 aa  94  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 417 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 460 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 397 aa  91.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 460 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  28.12 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  27.99 
 
 		 404 aa  87.8  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  28.42 
 
 		 403 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  24.54 
 
 		 905 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  26.32 
 
 		 917 aa  83.2  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  27.47 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  29.78 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>