More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2278 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  100 
 
 		 496 aa  995    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  53.43 
 
 		 491 aa  508  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  52.83 
 
 		 491 aa  511  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  51.11 
 
 		 488 aa  502  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  52.53 
 
 		 490 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  52.07 
 
 		 493 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  51.41 
 
 		 489 aa  495  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  51.71 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  51.61 
 
 		 488 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  50.6 
 
 		 489 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  50.31 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  50.2 
 
 		 489 aa  474  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  50.1 
 
 		 500 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  49.8 
 
 		 488 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  50.91 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  48.69 
 
 		 488 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  43.96 
 
 		 502 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  42.72 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  42.43 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  42.42 
 
 		 525 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  41.6 
 
 		 534 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  42.02 
 
 		 533 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  37.5 
 
 		 501 aa  332  8e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 504 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 502 aa  312  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  34.84 
 
 		 493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  28.27 
 
 		 438 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 434 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 431 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  29.12 
 
 		 437 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 436 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 451 aa  110  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  24.49 
 
 		 494 aa  103  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  31.05 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  24.9 
 
 		 507 aa  97.8  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 433 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 441 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 441 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 441 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 441 aa  97.4  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 		 442 aa  96.7  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 441 aa  93.6  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  31.68 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 440 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 440 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  40.83 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  33.99 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  33.99 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  33.99 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  33.99 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  33.99 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  33.99 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  33.99 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  30.53 
 
 		 905 aa  80.5  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1543  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  25.59 
 
 		 912 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  26.48 
 
 		 526 aa  74.3  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  26.51 
 
 		 917 aa  72.4  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  27.23 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  24.27 
 
 		 895 aa  68.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  36.6 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  26.09 
 
 		 893 aa  68.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  26.29 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 414 aa  67  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  26.24 
 
 		 431 aa  67  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  34.64 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  24.07 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  25.71 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  24.06 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  29.86 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>