More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1813 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  79.51 
 
 		 489 aa  806    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  70.79 
 
 		 493 aa  707    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  79.92 
 
 		 488 aa  810    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  67.83 
 
 		 489 aa  685    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  100 
 
 		 488 aa  973    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  69.26 
 
 		 488 aa  702    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  71.22 
 
 		 491 aa  681    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  68.03 
 
 		 489 aa  689    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  68.24 
 
 		 488 aa  680    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  80.74 
 
 		 488 aa  816    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  62.73 
 
 		 500 aa  629  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  60.69 
 
 		 503 aa  617  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  59.06 
 
 		 491 aa  592  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  58.66 
 
 		 491 aa  588  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  58.16 
 
 		 490 aa  578  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  52.42 
 
 		 502 aa  502  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  49.9 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  50.7 
 
 		 525 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  50.6 
 
 		 533 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  48.99 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  48.05 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  47.44 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  48.37 
 
 		 493 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  47.72 
 
 		 504 aa  430  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  45.68 
 
 		 501 aa  425  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  45.49 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 		 436 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  36.99 
 
 		 438 aa  141  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 434 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  29.67 
 
 		 494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  28.63 
 
 		 442 aa  126  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 431 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  28.19 
 
 		 507 aa  123  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  41 
 
 		 437 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  28.54 
 
 		 497 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 441 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  40 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 433 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  39.05 
 
 		 441 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  39.05 
 
 		 441 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  39.05 
 
 		 441 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  39.05 
 
 		 441 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  39.05 
 
 		 441 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  39.05 
 
 		 441 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  39.05 
 
 		 441 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  34.08 
 
 		 895 aa  94  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  31.89 
 
 		 912 aa  91.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  25.57 
 
 		 526 aa  91.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  37.8 
 
 		 441 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 449 aa  87.4  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  29.55 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1543  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  36.42 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  36.42 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  34.21 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  30.66 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  32.2 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  31.64 
 
 		 905 aa  78.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  31.98 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  31.46 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  30.65 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  34 
 
 		 389 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  34 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  34 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  26.32 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  32 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  33.55 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  23.94 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>