More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3528 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  84 
 
 		 533 aa  865    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  100 
 
 		 525 aa  1061    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  62.23 
 
 		 513 aa  660    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  62.3 
 
 		 513 aa  658    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  71.1 
 
 		 502 aa  751    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  82.55 
 
 		 534 aa  870    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  52.17 
 
 		 488 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  50.79 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  50.59 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  49.22 
 
 		 493 aa  482  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  49.6 
 
 		 489 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  49.6 
 
 		 488 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  50.1 
 
 		 490 aa  481  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  49.8 
 
 		 489 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  50.6 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  50.3 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  50.2 
 
 		 491 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  49.9 
 
 		 488 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  47.84 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  49.09 
 
 		 489 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  48.3 
 
 		 503 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  45.42 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  47.49 
 
 		 502 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  45.21 
 
 		 504 aa  428  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  44.34 
 
 		 493 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  41.93 
 
 		 496 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  28.38 
 
 		 438 aa  183  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  27.79 
 
 		 494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 		 436 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  36.79 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  25.39 
 
 		 507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  25.78 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  35.55 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 440 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 440 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  33.81 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 433 aa  96.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1543  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 206 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  34.01 
 
 		 917 aa  85.9  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  30.38 
 
 		 912 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  30.82 
 
 		 895 aa  83.2  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  31.08 
 
 		 422 aa  83.2  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 441 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  34.96 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  32.67 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  33.33 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  30.37 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  30.37 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  30.37 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  30.37 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  30.37 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  30.37 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  30.37 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  32 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  30.07 
 
 		 905 aa  77  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 438 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 417 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 438 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  28.76 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  31.33 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  31.33 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  32.62 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  28.66 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  36.42 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  24.66 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  28.09 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  31.74 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  28.21 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  29.41 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  32.24 
 
 		 497 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  33.78 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 401 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>