186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_2032 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  100 
 
 
442 aa  893    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  55.81 
 
 
478 aa  475  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  54.67 
 
 
471 aa  450  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  49.54 
 
 
526 aa  385  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  40.45 
 
 
439 aa  291  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  38.65 
 
 
438 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  35.08 
 
 
494 aa  255  9e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  38.59 
 
 
434 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  40.44 
 
 
451 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 
436 aa  239  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 
431 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 
458 aa  234  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 
434 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  35.6 
 
 
441 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  34.62 
 
 
441 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  34.62 
 
 
441 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  34.62 
 
 
441 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  35.33 
 
 
441 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  35.33 
 
 
441 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  34.78 
 
 
441 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  33.5 
 
 
437 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  33.65 
 
 
433 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  51.98 
 
 
216 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  35.31 
 
 
439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  34.63 
 
 
441 aa  183  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 
440 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 
440 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  32.53 
 
 
441 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  33.33 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  33.33 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  33.33 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  33.33 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  33.33 
 
 
441 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  33.33 
 
 
441 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  33.33 
 
 
441 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  29.58 
 
 
507 aa  160  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  28.67 
 
 
533 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  28.67 
 
 
534 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  28.44 
 
 
488 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  34.55 
 
 
488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  32.73 
 
 
497 aa  116  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  32.95 
 
 
493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  35.29 
 
 
500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  33.82 
 
 
488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  25.78 
 
 
525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  35.29 
 
 
503 aa  111  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  34.25 
 
 
488 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  33.82 
 
 
489 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  30.41 
 
 
491 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  32.69 
 
 
513 aa  104  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  32.82 
 
 
489 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  31.4 
 
 
491 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  31.88 
 
 
489 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  29.95 
 
 
491 aa  103  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  33.5 
 
 
502 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  33.82 
 
 
488 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  31.25 
 
 
513 aa  99.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  31.05 
 
 
496 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  29.03 
 
 
490 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
442 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  28.3 
 
 
501 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  25.91 
 
 
504 aa  84.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  26.98 
 
 
502 aa  84  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  26.02 
 
 
493 aa  81.3  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
444 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  26.02 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  26.63 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  24.46 
 
 
472 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  24.3 
 
 
905 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 
420 aa  67.4  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 
443 aa  67  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  24.39 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  24.19 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  25 
 
 
436 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  24.19 
 
 
431 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  22.22 
 
 
895 aa  65.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  23.53 
 
 
403 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  24.05 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  25.71 
 
 
435 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  23.08 
 
 
431 aa  63.9  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  25.24 
 
 
421 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 
506 aa  63.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 
417 aa  63.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  21.85 
 
 
912 aa  63.2  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  24.34 
 
 
417 aa  63.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  25.36 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  22.71 
 
 
441 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  25.08 
 
 
421 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  23.23 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  23.81 
 
 
426 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  22.35 
 
 
389 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  24.82 
 
 
404 aa  60.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  23.81 
 
 
426 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  22.35 
 
 
389 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  23.68 
 
 
403 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  22.37 
 
 
422 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  24.83 
 
 
422 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>