More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2642 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  62.35 
 
 		 525 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  64.69 
 
 		 534 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  94.74 
 
 		 513 aa  976    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  100 
 
 		 513 aa  1019    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  64.62 
 
 		 533 aa  669    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  62.62 
 
 		 502 aa  632  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  50.1 
 
 		 488 aa  474  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  48.55 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  45.99 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  48.62 
 
 		 489 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  48.16 
 
 		 488 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  48.51 
 
 		 490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  49.8 
 
 		 491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  48.03 
 
 		 488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  49.41 
 
 		 491 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  47.44 
 
 		 488 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  46.41 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  46.68 
 
 		 489 aa  425  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  45.74 
 
 		 489 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  46.02 
 
 		 500 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  46.38 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  44.78 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  45.18 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  45.78 
 
 		 493 aa  398  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 502 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  42.43 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  37.44 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 458 aa  143  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  29.27 
 
 		 437 aa  130  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 451 aa  129  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  28.05 
 
 		 494 aa  129  9.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  27.29 
 
 		 507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  29.93 
 
 		 441 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 431 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 440 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 440 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  27.84 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 441 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 441 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 442 aa  107  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  27.92 
 
 		 441 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  27.92 
 
 		 441 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  27.92 
 
 		 441 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  27.92 
 
 		 441 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  27.92 
 
 		 441 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  27.92 
 
 		 441 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  27.92 
 
 		 441 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  31.25 
 
 		 442 aa  99.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  28.57 
 
 		 441 aa  97.8  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 449 aa  93.6  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 433 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1543  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 206 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  32.87 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  28 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  30.56 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  27.15 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  26.98 
 
 		 895 aa  75.1  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  24.44 
 
 		 912 aa  74.7  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  36.55 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  34.67 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  30.91 
 
 		 403 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 397 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  28.28 
 
 		 403 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  34.48 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  34.48 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  29.41 
 
 		 403 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  35.33 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2441  nitrate transporter, putative  25.68 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0357  putative nitrate transporter  25.68 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2626  putative nitrate transporter  25.68 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1215  putative nitrate transporter  25.68 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  31.97 
 
 		 917 aa  71.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  29.27 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  30.77 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  30.19 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  27.56 
 
 		 403 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>