More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03167 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  100 
 
 		 441 aa  872    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  92.66 
 
 		 440 aa  733    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  92.66 
 
 		 440 aa  733    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  79.82 
 
 		 437 aa  610  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  79.45 
 
 		 439 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  70.78 
 
 		 441 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  71.33 
 
 		 433 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  71.3 
 
 		 441 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  71.3 
 
 		 441 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  71.3 
 
 		 441 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  70.6 
 
 		 441 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  70.6 
 
 		 441 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  71.3 
 
 		 441 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  72.58 
 
 		 441 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  71.63 
 
 		 441 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  71.39 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  71.63 
 
 		 441 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  71.39 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  71.39 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  71.39 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  71.63 
 
 		 441 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  53.26 
 
 		 438 aa  468  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  56.81 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  56.29 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  51.37 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  53.65 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  49.4 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  47.78 
 
 		 431 aa  378  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  37.36 
 
 		 494 aa  264  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  36.69 
 
 		 478 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  34.63 
 
 		 442 aa  232  8.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  37.56 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  32.7 
 
 		 526 aa  196  7e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  30.4 
 
 		 502 aa  192  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  32.61 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  29.49 
 
 		 513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  29.93 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  29.39 
 
 		 533 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  29.39 
 
 		 534 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  31.92 
 
 		 488 aa  161  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  30.72 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  29.68 
 
 		 507 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  28.54 
 
 		 491 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  28.31 
 
 		 490 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  30.34 
 
 		 493 aa  143  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 502 aa  143  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  40.59 
 
 		 501 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  28.93 
 
 		 489 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 503 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  40 
 
 		 488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  38.42 
 
 		 489 aa  133  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  36.49 
 
 		 497 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  36.95 
 
 		 488 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  36.2 
 
 		 491 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  37.13 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  36.95 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  33.81 
 
 		 525 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  35.15 
 
 		 489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  31.68 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  38.22 
 
 		 216 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  30.95 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  30.61 
 
 		 431 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  28.53 
 
 		 403 aa  99.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 422 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 423 aa  94.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 444 aa  93.6  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 441 aa  93.2  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  32.36 
 
 		 424 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 421 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 421 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  32 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  32.36 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  32 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 394 aa  90.1  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  26.48 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  26.48 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  25.47 
 
 		 895 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  27.19 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  26.57 
 
 		 905 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  25.82 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  25.91 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  25.53 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  24.42 
 
 		 912 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  25.35 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  24.74 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  29.41 
 
 		 893 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>