More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3626 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  77.6 
 
 
449 aa  637    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
442 aa  869    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  29.37 
 
 
895 aa  127  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  28.64 
 
 
912 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  28.37 
 
 
905 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  27.25 
 
 
502 aa  120  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  26.96 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
420 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  26.89 
 
 
513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  26.89 
 
 
513 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  28.08 
 
 
525 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  38.1 
 
 
534 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  38.1 
 
 
533 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  27.3 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 
434 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  35.02 
 
 
488 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  26.63 
 
 
435 aa  110  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  26.77 
 
 
440 aa  109  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  28.83 
 
 
493 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  26.22 
 
 
418 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  33.75 
 
 
488 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  27.62 
 
 
491 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  29.31 
 
 
426 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  27.21 
 
 
438 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  26.04 
 
 
417 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  28.69 
 
 
893 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  26.53 
 
 
436 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
438 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
438 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  30.46 
 
 
452 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  26.21 
 
 
494 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  26.33 
 
 
453 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  32.92 
 
 
489 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  27.05 
 
 
431 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  28.65 
 
 
526 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  26.85 
 
 
431 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  22.22 
 
 
431 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  27.03 
 
 
917 aa  100  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  27.81 
 
 
472 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  29 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  35.68 
 
 
488 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  27.53 
 
 
488 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  26.11 
 
 
420 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  25.87 
 
 
426 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
443 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.87 
 
 
426 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  29.63 
 
 
439 aa  97.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  33.5 
 
 
489 aa  97.1  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  34.57 
 
 
488 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  36.02 
 
 
496 aa  97.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 
413 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
506 aa  96.7  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  30.85 
 
 
437 aa  96.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
417 aa  96.3  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  25.4 
 
 
426 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  26.75 
 
 
437 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
422 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  25.88 
 
 
500 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  28.85 
 
 
451 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  32.92 
 
 
503 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  28.27 
 
 
411 aa  94.4  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  25.9 
 
 
427 aa  93.6  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  28.61 
 
 
459 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 
460 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  27.2 
 
 
472 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  25.38 
 
 
425 aa  92.8  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  22.56 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  28.26 
 
 
478 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.87 
 
 
426 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.87 
 
 
426 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.87 
 
 
426 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  22.22 
 
 
424 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.87 
 
 
426 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 
397 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  26.68 
 
 
491 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  29.58 
 
 
398 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  25.87 
 
 
409 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  28.04 
 
 
404 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  33.03 
 
 
490 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  29.09 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  29.47 
 
 
460 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  25.33 
 
 
402 aa  90.5  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  32.49 
 
 
489 aa  89.7  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  27.72 
 
 
403 aa  89.7  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  28.3 
 
 
471 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0318  major facilitator transporter  28.17 
 
 
407 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
434 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  24.8 
 
 
504 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  25.47 
 
 
497 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 
431 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 
458 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  26.79 
 
 
429 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
397 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  29.17 
 
 
390 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  33.51 
 
 
491 aa  87  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  28.53 
 
 
406 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  28.53 
 
 
406 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  23.92 
 
 
389 aa  86.7  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>