More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2626 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  69.33 
 
 		 490 aa  701    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  90.02 
 
 		 491 aa  902    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  100 
 
 		 491 aa  986    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  61.3 
 
 		 488 aa  622  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  61.73 
 
 		 488 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  59.8 
 
 		 493 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  60.49 
 
 		 488 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  58.69 
 
 		 489 aa  601  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  60.29 
 
 		 491 aa  592  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  58.81 
 
 		 489 aa  587  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  58.45 
 
 		 489 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  59.06 
 
 		 488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  59.06 
 
 		 488 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  58.42 
 
 		 500 aa  569  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  57 
 
 		 503 aa  565  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  53.43 
 
 		 496 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  54.28 
 
 		 502 aa  498  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  51 
 
 		 534 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  50.81 
 
 		 525 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  51.52 
 
 		 533 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  49.7 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  49.41 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  43.8 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  42.39 
 
 		 493 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 502 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  34.29 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 458 aa  140  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  28.12 
 
 		 494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  39.17 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  28.96 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  30.41 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  25.11 
 
 		 497 aa  93.2  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  29.11 
 
 		 526 aa  92.8  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 441 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 441 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 441 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 441 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 449 aa  90.5  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1543  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 206 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  37.3 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  32.6 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  32.6 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  32.6 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  32.6 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  32.6 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  32.6 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  32.6 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  33.82 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  26.09 
 
 		 905 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  30.39 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  29.9 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  30.69 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  33.53 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  28.8 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  29.67 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  29.66 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  29.66 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  29.66 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  29.66 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  29.66 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  29.66 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  29.66 
 
 		 389 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  30.2 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  29.66 
 
 		 389 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  32.6 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  30.24 
 
 		 404 aa  72  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  29.86 
 
 		 895 aa  70.5  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>