More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2061 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 436 aa  865    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  65.03 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  63.02 
 
 		 434 aa  498  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  57.14 
 
 		 438 aa  490  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  54.86 
 
 		 434 aa  451  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  52.82 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  50.23 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  50 
 
 		 441 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  48.25 
 
 		 437 aa  342  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  52.04 
 
 		 439 aa  338  9e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  46.41 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  46.59 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  46.59 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  46.59 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  46.35 
 
 		 441 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  39.1 
 
 		 494 aa  306  6e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  48.96 
 
 		 441 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  47.09 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  47.09 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  47.09 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  47.09 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  47.09 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  47.09 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  47.09 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  37.53 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  39.47 
 
 		 478 aa  272  8.000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  40.71 
 
 		 471 aa  263  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  32.64 
 
 		 526 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  33.47 
 
 		 488 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  31.58 
 
 		 493 aa  192  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 488 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  30.82 
 
 		 497 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  31.26 
 
 		 491 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  30.91 
 
 		 488 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  31.67 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  30.6 
 
 		 489 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  30.58 
 
 		 534 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  30.58 
 
 		 533 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  31.04 
 
 		 513 aa  173  5e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  26.82 
 
 		 493 aa  170  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 504 aa  164  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  28.12 
 
 		 501 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  44.12 
 
 		 489 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  29.28 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  41.67 
 
 		 488 aa  156  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  39.13 
 
 		 513 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  41.06 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  31.44 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 503 aa  150  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  37.44 
 
 		 502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  36.82 
 
 		 525 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  39.45 
 
 		 507 aa  136  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  36.45 
 
 		 491 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 491 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  34.11 
 
 		 496 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  35.68 
 
 		 490 aa  126  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  37.43 
 
 		 216 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 502 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  28.97 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 421 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 421 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  27.47 
 
 		 422 aa  96.7  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  27.52 
 
 		 431 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 411 aa  96.3  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 417 aa  96.3  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  25.53 
 
 		 895 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  23.91 
 
 		 912 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  26.76 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  26.76 
 
 		 426 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  26.76 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  27.52 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  28.65 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 444 aa  94  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  24.47 
 
 		 905 aa  93.2  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  27.07 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 422 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 460 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 413 aa  90.5  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  28.27 
 
 		 404 aa  90.5  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 427 aa  89.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  28.87 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 460 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  26.9 
 
 		 403 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  28.27 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  28.27 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 459 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  27.72 
 
 		 424 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>