More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1069 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  72.22 
 
 
525 aa  744    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  63.6 
 
 
513 aa  635    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  73.8 
 
 
533 aa  736    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  100 
 
 
502 aa  1015    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  72.64 
 
 
534 aa  738    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  62.62 
 
 
513 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  55.12 
 
 
488 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  54.02 
 
 
488 aa  501  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  53.13 
 
 
488 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  54.28 
 
 
491 aa  498  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  52.22 
 
 
489 aa  495  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  51.71 
 
 
493 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  52.55 
 
 
488 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  51.72 
 
 
489 aa  490  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  53.03 
 
 
491 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  52.05 
 
 
488 aa  485  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  52.14 
 
 
489 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  51.13 
 
 
490 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  51.84 
 
 
491 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  50.2 
 
 
503 aa  475  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  50.21 
 
 
500 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  48.77 
 
 
501 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  47.62 
 
 
502 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  47.14 
 
 
493 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  47.18 
 
 
504 aa  426  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  43.96 
 
 
496 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  30.79 
 
 
438 aa  196  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
434 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 
458 aa  163  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  30.4 
 
 
441 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  30.92 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  27.9 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  30.32 
 
 
439 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  27.29 
 
 
494 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  29.23 
 
 
433 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 
436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  27.71 
 
 
441 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  27.71 
 
 
441 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  27.71 
 
 
441 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  27.22 
 
 
441 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  27.22 
 
 
441 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  27.22 
 
 
441 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  26.1 
 
 
507 aa  116  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
431 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  26.39 
 
 
441 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  26.83 
 
 
441 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  26.83 
 
 
441 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  26.83 
 
 
441 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  26.83 
 
 
441 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  26.83 
 
 
441 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  26.83 
 
 
441 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  26.83 
 
 
441 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 
434 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 
449 aa  104  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  33.5 
 
 
442 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  34.9 
 
 
917 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  31.67 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  27.96 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1543  major facilitator transporter  31.85 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  30.46 
 
 
905 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  26.19 
 
 
431 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  30.11 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  27.78 
 
 
526 aa  80.1  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  26.56 
 
 
912 aa  80.1  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  29.93 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  29.5 
 
 
422 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  30.81 
 
 
424 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  30.81 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  30.3 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  26.67 
 
 
895 aa  77.8  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  34.15 
 
 
441 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.96 
 
 
460 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 
438 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  34.04 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  34.04 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  32.43 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  32 
 
 
421 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  32 
 
 
421 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 
438 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  33.33 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  30.15 
 
 
424 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  32.24 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  28.82 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 
506 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  34.04 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
435 aa  73.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  31.25 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  25.47 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  32.89 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  37.67 
 
 
478 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  33.77 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  36.99 
 
 
471 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>