More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4401 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  95.24 
 
 		 441 aa  758    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  94.78 
 
 		 441 aa  764    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  878    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  95.46 
 
 		 441 aa  759    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  92.36 
 
 		 441 aa  724    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  95.46 
 
 		 441 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  878    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  80.85 
 
 		 441 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  80.85 
 
 		 441 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  80.85 
 
 		 441 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  80.85 
 
 		 441 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  80.85 
 
 		 441 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  81.56 
 
 		 441 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  80.85 
 
 		 441 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  80.85 
 
 		 441 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  70.39 
 
 		 441 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  71.1 
 
 		 433 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  70.48 
 
 		 440 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  70.48 
 
 		 440 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  69.27 
 
 		 437 aa  524  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  70.09 
 
 		 439 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  50.23 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  55.5 
 
 		 434 aa  425  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  51.4 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  50.8 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  46.87 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  45.61 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  48.72 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  37.53 
 
 		 494 aa  250  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  36.69 
 
 		 442 aa  232  8.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  36.87 
 
 		 478 aa  222  9e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  36.36 
 
 		 471 aa  207  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  31.08 
 
 		 526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  34.93 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  28.77 
 
 		 488 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  29.67 
 
 		 488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  27.36 
 
 		 502 aa  166  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  29.76 
 
 		 493 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  28.99 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  28.99 
 
 		 513 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 503 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  37.61 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  38.42 
 
 		 491 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  27.7 
 
 		 491 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  37.38 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  37.25 
 
 		 489 aa  133  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  34.55 
 
 		 489 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  35.58 
 
 		 489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  34.7 
 
 		 501 aa  127  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 504 aa  126  7e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  36.14 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  35.27 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  32.27 
 
 		 496 aa  123  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  35.19 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  27.84 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  27.84 
 
 		 533 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  31.88 
 
 		 525 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  39.18 
 
 		 507 aa  109  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  31.06 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  30.72 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  35.71 
 
 		 216 aa  97.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  28.21 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  27.23 
 
 		 905 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.29 
 
 		 426 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  25.29 
 
 		 426 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 444 aa  86.3  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  24.13 
 
 		 895 aa  84.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  23.11 
 
 		 912 aa  84  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1444  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  27.48 
 
 		 893 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  24.62 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  24.62 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  24.62 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  24.62 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  24.62 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  24.62 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  24.62 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  24.62 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  29.2 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  25.06 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  25 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  25 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  28.17 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  27.86 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  27.4 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  27.87 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>