267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3139 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  68.29 
 
 
493 aa  713    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  81.98 
 
 
502 aa  812    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  68.5 
 
 
504 aa  709    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
501 aa  1011    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  48.77 
 
 
502 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  46.25 
 
 
525 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  46.11 
 
 
488 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  46.35 
 
 
534 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  47.44 
 
 
533 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  46.85 
 
 
488 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  45.47 
 
 
489 aa  423  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  45.28 
 
 
488 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  46.43 
 
 
491 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  47.22 
 
 
503 aa  422  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  45.92 
 
 
489 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  44.98 
 
 
513 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  47.09 
 
 
488 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  47.22 
 
 
500 aa  420  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  44.77 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  44.63 
 
 
489 aa  415  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  44.78 
 
 
513 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  44.51 
 
 
488 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  43.94 
 
 
490 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  43.8 
 
 
491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  45.15 
 
 
491 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  37.5 
 
 
496 aa  332  8e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
434 aa  163  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  27.31 
 
 
451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
431 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  34.45 
 
 
438 aa  137  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  31.96 
 
 
441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
434 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
440 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
440 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  30.14 
 
 
433 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  27.42 
 
 
494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  36.45 
 
 
437 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  37.13 
 
 
439 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  29.91 
 
 
441 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  26.11 
 
 
478 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  35.16 
 
 
441 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  35.16 
 
 
441 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  35.16 
 
 
441 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  34.7 
 
 
441 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  34.7 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  34.7 
 
 
441 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  36.82 
 
 
441 aa  97.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0582017 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  24.25 
 
 
507 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  38.27 
 
 
441 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  38.27 
 
 
441 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  38.27 
 
 
441 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  38.27 
 
 
441 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  38.27 
 
 
441 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  38.27 
 
 
441 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  38.27 
 
 
441 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  28.3 
 
 
442 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  27.62 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  23.92 
 
 
526 aa  80.9  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  29.73 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  29.22 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  29.22 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  36.17 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  27.31 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  28.77 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
449 aa  69.7  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1543  major facilitator transporter  34.62 
 
 
206 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  28.77 
 
 
424 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  29.29 
 
 
893 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  24.55 
 
 
912 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  31.58 
 
 
216 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  26.85 
 
 
431 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  28.77 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  29.68 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  26.63 
 
 
895 aa  67  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  27.98 
 
 
424 aa  67  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 
403 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  26.76 
 
 
439 aa  64.3  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  32.26 
 
 
399 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  28.11 
 
 
422 aa  63.5  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  25.24 
 
 
441 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  26.46 
 
 
436 aa  63.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  26.82 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  30.12 
 
 
398 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  27.5 
 
 
452 aa  61.6  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  26.82 
 
 
389 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  27.37 
 
 
414 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  26.82 
 
 
389 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  26.82 
 
 
389 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
422 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  29.19 
 
 
406 aa  60.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  26.82 
 
 
389 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>