More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1343 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  94.91 
 
 
441 aa  739    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  100 
 
 
441 aa  877    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  96.15 
 
 
441 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  95.92 
 
 
441 aa  757    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  94.78 
 
 
441 aa  753    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  94.78 
 
 
441 aa  753    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  96.15 
 
 
441 aa  759    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  81.56 
 
 
441 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  81.56 
 
 
441 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  81.56 
 
 
441 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  81.56 
 
 
441 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  81.56 
 
 
441 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  82.27 
 
 
441 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  81.56 
 
 
441 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  81.56 
 
 
441 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  70.78 
 
 
441 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  71.36 
 
 
440 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  71.36 
 
 
440 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  71.56 
 
 
433 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  69.72 
 
 
437 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  70.78 
 
 
439 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  50 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  54.57 
 
 
434 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  52.34 
 
 
451 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  51.37 
 
 
458 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  47.33 
 
 
431 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  45.73 
 
 
434 aa  361  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 
436 aa  355  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  37.23 
 
 
494 aa  249  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  35.92 
 
 
442 aa  231  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  37.47 
 
 
478 aa  226  7e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  36.71 
 
 
471 aa  209  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  35.73 
 
 
439 aa  191  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  31.62 
 
 
526 aa  186  6e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  29.18 
 
 
488 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  27.54 
 
 
502 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  29.49 
 
 
513 aa  160  5e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  29.14 
 
 
513 aa  156  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  30.54 
 
 
502 aa  153  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  37.67 
 
 
500 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  37.68 
 
 
503 aa  144  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  39.45 
 
 
488 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  37.56 
 
 
491 aa  140  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  29.32 
 
 
507 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  36.45 
 
 
488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  37.93 
 
 
488 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  38.24 
 
 
489 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  36.74 
 
 
488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  36.95 
 
 
489 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  36.54 
 
 
489 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  35.96 
 
 
493 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  36.04 
 
 
504 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  35.71 
 
 
490 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  35.64 
 
 
493 aa  126  6e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  36.99 
 
 
501 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  33.03 
 
 
491 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  32.73 
 
 
496 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  32.58 
 
 
491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  35.55 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  32.41 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  32.26 
 
 
533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  30.53 
 
 
525 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  29.34 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  32.42 
 
 
431 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  32.08 
 
 
431 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  36.26 
 
 
216 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  26.39 
 
 
426 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  26.39 
 
 
426 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
444 aa  93.2  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  27.37 
 
 
403 aa  92.8  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
420 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
442 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
443 aa  90.1  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  29.18 
 
 
427 aa  89.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  25.68 
 
 
895 aa  89  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  25.25 
 
 
389 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  24.88 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  25.38 
 
 
389 aa  87.8  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  25.38 
 
 
389 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  26.6 
 
 
402 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  25.38 
 
 
389 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  25.38 
 
 
389 aa  87.8  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  25.93 
 
 
426 aa  87.4  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  25.38 
 
 
389 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  23.67 
 
 
912 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  24.88 
 
 
389 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  27.41 
 
 
403 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  28.11 
 
 
429 aa  87  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  28.32 
 
 
422 aa  87  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
460 aa  87  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
506 aa  86.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  25.13 
 
 
389 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  27.69 
 
 
905 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  29.86 
 
 
424 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  28.75 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  29.76 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  24.75 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  28.32 
 
 
424 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  27.09 
 
 
404 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>