More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2763 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  79.51 
 
 		 488 aa  794    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  69.98 
 
 		 493 aa  714    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  69.26 
 
 		 489 aa  704    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  68.24 
 
 		 489 aa  689    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  85.04 
 
 		 488 aa  847    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  69.73 
 
 		 491 aa  688    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  69.26 
 
 		 488 aa  698    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  81.76 
 
 		 488 aa  828    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  72.13 
 
 		 488 aa  734    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  100 
 
 		 489 aa  973    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  62.73 
 
 		 500 aa  625  1e-178  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  61.1 
 
 		 503 aa  620  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  58.78 
 
 		 490 aa  588  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  58.86 
 
 		 491 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  58.45 
 
 		 491 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  52.14 
 
 		 502 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  50.6 
 
 		 496 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  50.2 
 
 		 525 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  49.31 
 
 		 534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  50 
 
 		 533 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  48.62 
 
 		 513 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  48.44 
 
 		 513 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  46.85 
 
 		 504 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  46.14 
 
 		 493 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  44.63 
 
 		 501 aa  415  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 502 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  30.42 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  35.58 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  27.65 
 
 		 507 aa  126  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  39.41 
 
 		 437 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 431 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  37.61 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 439 aa  113  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  28.66 
 
 		 497 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  38.42 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 440 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 440 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 441 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  31.88 
 
 		 442 aa  103  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  38.54 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  38.54 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  38.54 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  38.54 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  38.54 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  38.54 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  38.54 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  27.67 
 
 		 526 aa  91.3  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  34.38 
 
 		 441 aa  89.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  29.29 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1543  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 206 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  30.17 
 
 		 895 aa  82.4  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  29.83 
 
 		 912 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  31.07 
 
 		 905 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  27.62 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  29.26 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  32.56 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  30.05 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  28.8 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  30.6 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  32.24 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  31.82 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 395 aa  73.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 424 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 425 aa  73.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  36.59 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>