More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1551 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  64.29 
 
 		 493 aa  656    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  65.17 
 
 		 488 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  64.29 
 
 		 491 aa  635    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  85.95 
 
 		 503 aa  862    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  100 
 
 		 500 aa  997    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  64.97 
 
 		 488 aa  643    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  63.14 
 
 		 488 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  64.9 
 
 		 489 aa  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  62.73 
 
 		 489 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  62.32 
 
 		 489 aa  632  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  62.73 
 
 		 488 aa  622  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  61.55 
 
 		 488 aa  621  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  59.43 
 
 		 491 aa  590  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  58.01 
 
 		 490 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  58.42 
 
 		 491 aa  580  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  50.1 
 
 		 496 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  48.41 
 
 		 525 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  50.21 
 
 		 502 aa  464  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  47.32 
 
 		 534 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  48.08 
 
 		 533 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  47.22 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  46.02 
 
 		 513 aa  425  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  44.94 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  44.44 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  46.37 
 
 		 502 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  31.36 
 
 		 438 aa  203  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 451 aa  139  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  27.78 
 
 		 494 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  38.07 
 
 		 437 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  40.29 
 
 		 431 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 441 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 441 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 441 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 441 aa  117  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  35.29 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  25.47 
 
 		 507 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  28.94 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  38.02 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  38.02 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  38.02 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  38.02 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  38.02 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  38.02 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  38.02 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  39.79 
 
 		 441 aa  97.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  23.11 
 
 		 905 aa  96.3  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 442 aa  93.6  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  28.7 
 
 		 526 aa  89.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 449 aa  87.4  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  29.07 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  33.77 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  28.64 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1543  major facilitator transporter  30 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  30.16 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 506 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  24.28 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  28.36 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  29.28 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  27.19 
 
 		 917 aa  73.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  27.37 
 
 		 895 aa  73.6  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  26.82 
 
 		 912 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  29.55 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  27.11 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 453 aa  72  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  27.11 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  28.73 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  27.62 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  27.78 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>