More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2317 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
392 aa  746    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  56.51 
 
 
395 aa  389  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  47.78 
 
 
407 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  45.68 
 
 
412 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  38.94 
 
 
405 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  35.73 
 
 
418 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 
431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  35.18 
 
 
425 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  34.13 
 
 
418 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  32.96 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 
411 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  33.52 
 
 
420 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  33.33 
 
 
420 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  37.09 
 
 
420 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  37.73 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  35.87 
 
 
412 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  31.62 
 
 
418 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 
415 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
413 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
425 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  30.96 
 
 
417 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  32.76 
 
 
414 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 
415 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  29.89 
 
 
434 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  34.87 
 
 
430 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  34.87 
 
 
412 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  34.87 
 
 
430 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  34.87 
 
 
412 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  33.33 
 
 
413 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  34.87 
 
 
412 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  34.87 
 
 
412 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  34.87 
 
 
412 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  29.37 
 
 
434 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  34.11 
 
 
431 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  34.17 
 
 
412 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  33.33 
 
 
414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
412 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  34.59 
 
 
493 aa  146  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  34.07 
 
 
423 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  34.34 
 
 
410 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  28.76 
 
 
445 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  34.44 
 
 
405 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  33.42 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  33.42 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  33.8 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  34.07 
 
 
410 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  31.11 
 
 
415 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  34.2 
 
 
416 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  34.94 
 
 
461 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  30.96 
 
 
416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 
421 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  32.99 
 
 
410 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  30.46 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  29.89 
 
 
434 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  27.98 
 
 
432 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  30.75 
 
 
432 aa  123  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  30.25 
 
 
434 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
413 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  30.17 
 
 
417 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.17 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  33.04 
 
 
397 aa  117  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  28.72 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  28.98 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  32.59 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  31.77 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  34.83 
 
 
417 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  32.59 
 
 
390 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  27.53 
 
 
443 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  28.45 
 
 
430 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  27.53 
 
 
443 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  28.21 
 
 
430 aa  106  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
436 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  28.45 
 
 
420 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
420 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  28.83 
 
 
450 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
371 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
439 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
439 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.12 
 
 
430 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  25.53 
 
 
430 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  33.78 
 
 
432 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  33.78 
 
 
432 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  30.48 
 
 
407 aa  97.4  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
407 aa  97.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
395 aa  96.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  25.32 
 
 
426 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  28.29 
 
 
427 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
441 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  37.66 
 
 
451 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  28 
 
 
422 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  25.8 
 
 
437 aa  94.4  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  25.8 
 
 
437 aa  94.4  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  23.97 
 
 
406 aa  94  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  29.66 
 
 
433 aa  93.6  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  21.47 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  31.67 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  21.47 
 
 
410 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  25.79 
 
 
426 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>