209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54560 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  100 
 
 		 526 aa  1067    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  49.54 
 
 		 442 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  49.08 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  44.66 
 
 		 471 aa  360  4e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  34.22 
 
 		 438 aa  253  9.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  32.02 
 
 		 494 aa  240  5e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  37.32 
 
 		 451 aa  239  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 431 aa  233  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  37.35 
 
 		 439 aa  226  9e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  27.39 
 
 		 497 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 441 aa  166  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  33.25 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 441 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 441 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 441 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 440 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 440 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  32.07 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  45.99 
 
 		 216 aa  153  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  33.43 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  29.29 
 
 		 507 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  32.04 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  32.04 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  32.04 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  32.04 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  32.04 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  32.04 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  32.04 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  24.32 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  24.84 
 
 		 488 aa  108  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  24.12 
 
 		 493 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  25.73 
 
 		 488 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  24.18 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  23.92 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  25.54 
 
 		 488 aa  103  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  25.68 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  25.22 
 
 		 489 aa  95.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 449 aa  93.6  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 491 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 503 aa  90.9  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  27.67 
 
 		 489 aa  90.9  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 488 aa  88.2  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  29.05 
 
 		 491 aa  87  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  28.64 
 
 		 491 aa  86.7  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  26.18 
 
 		 490 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  27.78 
 
 		 502 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  31.29 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  23.16 
 
 		 905 aa  76.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  30.56 
 
 		 513 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  28.57 
 
 		 533 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  28.17 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  26.48 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 504 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  21.94 
 
 		 912 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  24.07 
 
 		 525 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  23.91 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  23.24 
 
 		 895 aa  69.7  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 411 aa  67  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  24.24 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  23.24 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  23.45 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  23.84 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  23.45 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 		 460 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  26.16 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  23.81 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>