More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2773 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 434 aa  855    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  64.8 
 
 		 451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  59.11 
 
 		 438 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  61.28 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  54.86 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  56.81 
 
 		 441 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  52.48 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  55.06 
 
 		 433 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  50.71 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  54.57 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  55.5 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  55.5 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  55.43 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  55.43 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  55.04 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  55.4 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  55.04 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  55.04 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  55.14 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  54.8 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  53.21 
 
 		 441 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  53.68 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  53.68 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  53.68 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  53.68 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  53.68 
 
 		 441 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  53.68 
 
 		 441 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  53.68 
 
 		 441 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  39.81 
 
 		 494 aa  307  3e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  42.65 
 
 		 478 aa  288  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  38.59 
 
 		 442 aa  280  5e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  41.93 
 
 		 471 aa  270  5e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  34.71 
 
 		 526 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  29.47 
 
 		 502 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  32.8 
 
 		 488 aa  182  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 488 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  29.59 
 
 		 493 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  29.17 
 
 		 501 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  28.51 
 
 		 497 aa  176  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  32.7 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  30.44 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  30.72 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 504 aa  166  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  28.54 
 
 		 491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  28.48 
 
 		 507 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  38.43 
 
 		 488 aa  149  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  37.56 
 
 		 488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  38.14 
 
 		 489 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  35.68 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 491 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 502 aa  143  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  38.16 
 
 		 493 aa  143  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  34.53 
 
 		 513 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  34.98 
 
 		 513 aa  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  26.98 
 
 		 534 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 500 aa  137  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  27.33 
 
 		 533 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  38 
 
 		 488 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  27.83 
 
 		 525 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  34.27 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  30.81 
 
 		 496 aa  126  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 442 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  37.27 
 
 		 216 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  26.67 
 
 		 912 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  26.65 
 
 		 895 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  29.33 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  25.63 
 
 		 905 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 449 aa  96.3  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  26.28 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  26.28 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  30.74 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  30.41 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  30.41 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  25.96 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  27.11 
 
 		 452 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  25.87 
 
 		 422 aa  87  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  25 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  28.64 
 
 		 403 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 441 aa  86.7  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  29.63 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  28.17 
 
 		 893 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  24.26 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  24.41 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  26.74 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  26.27 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>