More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2277 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  72.19 
 
 		 491 aa  728    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  100 
 
 		 490 aa  984    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  69.33 
 
 		 491 aa  701    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  61.43 
 
 		 488 aa  614  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  60.82 
 
 		 488 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  59.96 
 
 		 488 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  58.78 
 
 		 489 aa  588  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  59.18 
 
 		 488 aa  591  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  57.55 
 
 		 489 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  58.16 
 
 		 488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  58.01 
 
 		 500 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  56.59 
 
 		 503 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  56.03 
 
 		 493 aa  559  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  57.82 
 
 		 491 aa  561  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  55.51 
 
 		 489 aa  560  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  52.53 
 
 		 496 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  51.13 
 
 		 502 aa  484  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  51.02 
 
 		 525 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  49.8 
 
 		 534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  50.92 
 
 		 533 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  48.9 
 
 		 513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  48.51 
 
 		 513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  47.02 
 
 		 504 aa  413  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  43.94 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  46.32 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 502 aa  381  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  28.57 
 
 		 438 aa  173  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  27.07 
 
 		 494 aa  123  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  26.9 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  28.31 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  36.24 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 436 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 440 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 440 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 		 431 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  36.49 
 
 		 441 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  36.49 
 
 		 441 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  36.49 
 
 		 441 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  36.49 
 
 		 441 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  36.49 
 
 		 441 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  36.49 
 
 		 441 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  29.03 
 
 		 442 aa  96.3  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  36.49 
 
 		 441 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 434 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  43.33 
 
 		 441 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  27.35 
 
 		 471 aa  86.7  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  26.18 
 
 		 526 aa  85.5  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  27.12 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  30 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1543  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  26 
 
 		 905 aa  73.6  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  27.73 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 425 aa  73.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  30.16 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  33.11 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  30.33 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  27.49 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  27.74 
 
 		 917 aa  68.2  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  34.36 
 
 		 893 aa  67.8  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  26.82 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  27.44 
 
 		 404 aa  67  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 417 aa  67  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  36.71 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  21.52 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 398 aa  66.6  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  28.84 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  29.17 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  28.03 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>