More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2419 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  68.44 
 
 		 489 aa  693    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  70.93 
 
 		 493 aa  709    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  68.44 
 
 		 488 aa  683    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  71.72 
 
 		 488 aa  729    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  70.76 
 
 		 491 aa  694    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  63.19 
 
 		 503 aa  635    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  69.06 
 
 		 489 aa  698    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  69.26 
 
 		 489 aa  698    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  100 
 
 		 488 aa  976    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  71.52 
 
 		 488 aa  717    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  68.24 
 
 		 488 aa  670    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  64.97 
 
 		 500 aa  632  1e-180  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  61.43 
 
 		 490 aa  614  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  60.69 
 
 		 491 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  59.06 
 
 		 491 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  51.71 
 
 		 496 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  51.2 
 
 		 525 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  52.05 
 
 		 502 aa  485  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  49.9 
 
 		 534 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  50.6 
 
 		 533 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  48.55 
 
 		 513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  48.14 
 
 		 513 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  46.85 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  45.68 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  46.53 
 
 		 493 aa  411  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  47.26 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  30.52 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  30.12 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  30.12 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  30.12 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  30.12 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  30.12 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  30.12 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  30.12 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  39.41 
 
 		 437 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  30.63 
 
 		 441 aa  117  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  24.39 
 
 		 507 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 441 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 440 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 440 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  36.95 
 
 		 441 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 441 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 441 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 441 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 439 aa  106  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 441 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  33.82 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  24.79 
 
 		 497 aa  97.8  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 442 aa  97.1  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  25.67 
 
 		 905 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  29.61 
 
 		 895 aa  88.2  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  28.04 
 
 		 526 aa  88.2  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1543  major facilitator transporter  37.42 
 
 		 206 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  28.11 
 
 		 912 aa  87.4  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 441 aa  87  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  30.39 
 
 		 494 aa  86.7  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  30.33 
 
 		 424 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  30.32 
 
 		 424 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  30.05 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  30 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  30 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  28.46 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 422 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  31.89 
 
 		 436 aa  79.7  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  28.65 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  35.17 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 398 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  30.57 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>