More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1404 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 449 aa  879    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  77.6 
 
 		 442 aa  675    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  30.24 
 
 		 525 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  38.27 
 
 		 533 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  38.27 
 
 		 534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  28.32 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  37.76 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  26.87 
 
 		 912 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  26.75 
 
 		 895 aa  110  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 440 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  27.03 
 
 		 893 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  25.13 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  35.42 
 
 		 488 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  25.83 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  25.84 
 
 		 905 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  25 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  25.57 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  34.55 
 
 		 489 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  27.41 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  32.13 
 
 		 513 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  34.55 
 
 		 493 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  32.46 
 
 		 488 aa  99.8  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  25.88 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  26.37 
 
 		 438 aa  99.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.98 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  25.98 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  30.89 
 
 		 489 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  33.51 
 
 		 489 aa  98.6  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  29.63 
 
 		 526 aa  97.8  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 504 aa  97.8  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  26.63 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 503 aa  97.1  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  34.03 
 
 		 488 aa  96.7  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  25.98 
 
 		 431 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 500 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 491 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  27.98 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  35.38 
 
 		 490 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 488 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  27.86 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  30.46 
 
 		 437 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  27.79 
 
 		 917 aa  93.6  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.76 
 
 		 426 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.76 
 
 		 426 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  25.76 
 
 		 409 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.76 
 
 		 426 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.76 
 
 		 426 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  25.56 
 
 		 422 aa  93.2  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  25.2 
 
 		 493 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  24.43 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  26.8 
 
 		 491 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 459 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 413 aa  90.1  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  23.53 
 
 		 424 aa  90.1  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  31.94 
 
 		 488 aa  90.1  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  28.25 
 
 		 395 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  34.44 
 
 		 491 aa  89.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  28.64 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 429 aa  88.2  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0318  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 460 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 397 aa  87  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 398 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 460 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 472 aa  86.3  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 406 aa  86.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 422 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  24.77 
 
 		 494 aa  86.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  25.93 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  25 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  25 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  25.35 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  31.09 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>