More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2824 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  826    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  82.11 
 
 		 411 aa  655    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  69.36 
 
 		 417 aa  534  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  48.38 
 
 		 411 aa  352  8e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  47.59 
 
 		 420 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  45.74 
 
 		 422 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  46.43 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  45.61 
 
 		 423 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  43.83 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  43.96 
 
 		 422 aa  283  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  46.08 
 
 		 415 aa  278  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 421 aa  269  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 402 aa  253  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 403 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  32.99 
 
 		 407 aa  146  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  34.39 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  32.88 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  31.55 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  31.01 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  31.01 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  29.5 
 
 		 402 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0414  fosmidomycin resistance protein  29.05 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  34.93 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  29.05 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  30.06 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  29.05 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  29.28 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  29.28 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  29.28 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.03 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  29.28 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  29.28 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  29.28 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  29.28 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  29.28 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  25.95 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  25.91 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  29.48 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  29.48 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  29.48 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0053  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.74 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.89 
 
 		 534 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.74 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  25.09 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.58 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>