More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3444 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  100 
 
 
403 aa  783    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  99.75 
 
 
403 aa  780    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  99.75 
 
 
403 aa  780    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  83.12 
 
 
393 aa  626  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  84.5 
 
 
404 aa  617  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  63.97 
 
 
406 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  56.46 
 
 
402 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  61.79 
 
 
440 aa  388  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4249  major facilitator superfamily MFS_1  58.96 
 
 
416 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  52.18 
 
 
446 aa  358  7e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2789  major facilitator superfamily protein MFS_1  56.45 
 
 
568 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0045  major facilitator transporter  54.97 
 
 
417 aa  348  7e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6077  major facilitator superfamily MFS_1  54.73 
 
 
407 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6118  major facilitator superfamily protein MFS_1  55.32 
 
 
402 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.39659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  55.87 
 
 
565 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2998  major facilitator superfamily MFS_1  52.88 
 
 
412 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156539  decreased coverage  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  55.32 
 
 
408 aa  332  7.000000000000001e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  48.13 
 
 
386 aa  319  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  54.26 
 
 
407 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01420  arabinose efflux permease family protein  48.29 
 
 
431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  47.97 
 
 
422 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  47.65 
 
 
428 aa  282  6.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1563  major facilitator superfamily MFS_1  51.75 
 
 
424 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 
385 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  37.04 
 
 
387 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  37.04 
 
 
387 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  37.04 
 
 
387 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  36.77 
 
 
387 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  36.51 
 
 
387 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  37.04 
 
 
387 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  36.51 
 
 
387 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  36.51 
 
 
387 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  36.51 
 
 
387 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  36.51 
 
 
387 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  36.49 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  40.94 
 
 
368 aa  199  9e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2675  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 
402 aa  186  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.429667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  24.94 
 
 
392 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.5 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  23.58 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  23.58 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.88 
 
 
485 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  23.06 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.9 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  26.47 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  23.58 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.12 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  27.49 
 
 
396 aa  67  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 
406 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3218  major facilitator transporter  25.07 
 
 
402 aa  67  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  24.12 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  24.23 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.31 
 
 
478 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  26.57 
 
 
426 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
463 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  27.8 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  28.66 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.67 
 
 
534 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  22.97 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.95 
 
 
517 aa  65.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  25.13 
 
 
393 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
407 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.27 
 
 
440 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 
520 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  25.13 
 
 
393 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.43 
 
 
398 aa  64.3  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.3 
 
 
396 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
497 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
403 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.71 
 
 
478 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.42 
 
 
545 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.11 
 
 
478 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 
513 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  24.67 
 
 
402 aa  63.2  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.11 
 
 
484 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  28.93 
 
 
471 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.91 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  27.82 
 
 
391 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  26.19 
 
 
406 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  31.98 
 
 
405 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  27.51 
 
 
474 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.34 
 
 
525 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.12 
 
 
478 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  24.85 
 
 
430 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0914  MFS permease  30.86 
 
 
473 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 
503 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.91 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
439 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  27.1 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
521 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.18 
 
 
493 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>