88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3046 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 390 aa  747    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  48.84 
 
 		 386 aa  344  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1899  major facilitator superfamily MFS_1  48.84 
 
 		 387 aa  329  6e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1455  major facilitator superfamily MFS_1  51.03 
 
 		 394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0319  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  22.16 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1679  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  32.5 
 
 		 426 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  32.5 
 
 		 426 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0241  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0694015 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  32.93 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.89 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 438 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  26.75 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.89 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 427 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  26.54 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2162  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  26.54 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  30 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0861  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.605059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  30.7 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.84 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0884  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  23.86 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 438 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 438 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2428  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 555 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2434  major facilitator superfamily transporter  34.23 
 
 		 555 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.356291  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2387  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 555 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0964642  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  28.19 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3423  hypothetical protein  23.72 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 421 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0741  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.662794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  27.23 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2951  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 584 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.380575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 424 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  28.73 
 
 		 424 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 443 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0437  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 552 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0763251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0694  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.794303  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  29.29 
 
 		 491 aa  43.9  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 424 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2430  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 432 aa  43.5  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  26.85 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  26.04 
 
 		 431 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  24.59 
 
 		 399 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 		 441 aa  43.1  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 506 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  22.68 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>