167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0222 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 388 aa  775    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  25.96 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  25.91 
 
 		 407 aa  94  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2822  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 420 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  23.43 
 
 		 435 aa  87  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  24.14 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  24.48 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  25 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  24.86 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  24.35 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  25.26 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  25.14 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  25.22 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  25.22 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  25.35 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  26.49 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  23.37 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  26.14 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  25.56 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  23.92 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  23.92 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  23.92 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  23.92 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  23.92 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  24.28 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  23.53 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  24.07 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  24.07 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0849  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  22.32 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  23.32 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  25.39 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  23.91 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  26.92 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  22.32 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  24 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  24.71 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  24.03 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  25.2 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  25.89 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  21.65 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  21.67 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  22.41 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  23.91 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  24.27 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  20.83 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  24.17 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  23.17 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  22.41 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  24.93 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  22.16 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  22.1 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  21.99 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  21.7 
 
 		 440 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  23.95 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  22.19 
 
 		 414 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  23.68 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  21.81 
 
 		 458 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  21.53 
 
 		 452 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  23.58 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  23.37 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.01 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25.57 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  21.47 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  20.17 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  21.64 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  22.34 
 
 		 438 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  19.89 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  21.19 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  20.62 
 
 		 431 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  20.79 
 
 		 432 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  20.62 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  20.79 
 
 		 432 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  20.79 
 
 		 432 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  21.26 
 
 		 432 aa  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  19.89 
 
 		 432 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  21.29 
 
 		 452 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  19.8 
 
 		 431 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  25.13 
 
 		 439 aa  49.7  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  20.88 
 
 		 409 aa  49.7  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 		 422 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  24.54 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  22.5 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  20.16 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  21.47 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>