71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0741 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0741  major facilitator transporter  100 
 
 		 355 aa  683    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.662794  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0038  major facilitator superfamily MFS_1  49.16 
 
 		 355 aa  322  9.000000000000001e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1153  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0530  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0660  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0644  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 362 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.592278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  25 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 390 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0368  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 484 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1712  multidrug resistance transporter, Bcr family  25 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  30.94 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.42 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  30.94 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  27.12 
 
 		 453 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 432 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 472 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  27.01 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 419 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 456 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  31.06 
 
 		 434 aa  46.6  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 417 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 421 aa  46.2  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0747  major facilitator superfamily transporter  29.73 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  23.72 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 525 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2822  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  27.54 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  30 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  26.72 
 
 		 444 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 464 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  23.1 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  28.21 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  28.21 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  23.4 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  28.21 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  28.21 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  23.4 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 403 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02050  arabinose efflux permease family protein  26.77 
 
 		 446 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 414 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  28.21 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  28.21 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  23.4 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  23.4 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02430  transporter, putative  28.51 
 
 		 453 aa  43.5  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  23.4 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  28.21 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  28.21 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  23.4 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 438 aa  42.7  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  27.35 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  25 
 
 		 472 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 678 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 		 454 aa  42.7  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 386 aa  42.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 381 aa  42.7  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>