142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0803 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  100 
 
 
383 aa  745    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  31.52 
 
 
403 aa  162  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  32.38 
 
 
396 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  30.92 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  29.2 
 
 
392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  30.4 
 
 
399 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  30.97 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 
332 aa  125  9e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  30.87 
 
 
405 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  26.36 
 
 
387 aa  107  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  26.33 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 
394 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  25.26 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  24.71 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
420 aa  67.4  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  23.91 
 
 
386 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
414 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  24.65 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
414 aa  59.7  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  20.35 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  22.86 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  26.44 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25.42 
 
 
405 aa  56.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  28.26 
 
 
406 aa  56.2  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
407 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 
391 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  23.77 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
425 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  30.69 
 
 
421 aa  53.9  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 
401 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  23.19 
 
 
399 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  23.1 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  23.1 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  23.1 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  23.1 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  22.81 
 
 
399 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  23.26 
 
 
399 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  25.6 
 
 
422 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  24.88 
 
 
474 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4700  major facilitator transporter  25.32 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164238  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 
408 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6033  major facilitator transporter  24.68 
 
 
426 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486241  normal  0.0413157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  22.67 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  21.71 
 
 
404 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  24.26 
 
 
403 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  24.44 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  23.03 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  21.39 
 
 
400 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  24.77 
 
 
419 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4878  major facilitator transporter  25 
 
 
426 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  20.94 
 
 
451 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  23.23 
 
 
410 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5470  major facilitator transporter  24.68 
 
 
426 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5392  major facilitator transporter  24.68 
 
 
426 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 
411 aa  49.7  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.93 
 
 
525 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  24.62 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  25.18 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  26.22 
 
 
458 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 
439 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  21.79 
 
 
479 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  22.9 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  26.83 
 
 
409 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  22.06 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  26.83 
 
 
409 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  26.83 
 
 
409 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1153  major facilitator transporter  26.82 
 
 
367 aa  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  27.72 
 
 
406 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  25.95 
 
 
409 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.63 
 
 
493 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 
423 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0741  major facilitator transporter  27.01 
 
 
355 aa  47  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.662794  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 
525 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0244  major facilitator superfamily permease  24.19 
 
 
473 aa  46.6  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00531035  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  22.12 
 
 
410 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.82 
 
 
428 aa  46.6  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.55 
 
 
500 aa  46.2  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
437 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  22.54 
 
 
487 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
476 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 
517 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  23.32 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  20.8 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.93 
 
 
489 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  26.79 
 
 
500 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
437 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.76 
 
 
485 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  26.49 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.11 
 
 
517 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
497 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 
388 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>