169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1153 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1153  major facilitator transporter  100 
 
 		 367 aa  701    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0741  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.662794  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0038  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0530  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 360 aa  156  4e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0660  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0644  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.592278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0084  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 589 aa  62.8  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0483176  normal  0.0703431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  29.33 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  29.35 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  30.83 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 466 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.23 
 
 		 436 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 461 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 477 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 439 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 456 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25 
 
 		 448 aa  53.1  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 443 aa  53.1  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  30.6 
 
 		 388 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 589 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2321  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 582 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 442 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 413 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 573 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 442 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 442 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 439 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 450 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 582 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 525 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2306  major facilitator superfamily transporter  32.23 
 
 		 543 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864673  normal  0.0994822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.23 
 
 		 543 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2962  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2971  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1098  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 591 aa  48.5  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.948323  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  26.82 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 440 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 440 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.06 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.67 
 
 		 469 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 452 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 439 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 439 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 442 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.81 
 
 		 486 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 429 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 458 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3195  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 445 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.15 
 
 		 521 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.55 
 
 		 609 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 483 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 440 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  22.86 
 
 		 438 aa  46.6  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 380 aa  46.2  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 396 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 413 aa  46.2  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.74 
 
 		 487 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.13 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.67 
 
 		 493 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2058  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  26.03 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>