More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02050 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02050  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 446 aa  832    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 407 aa  104  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.07 
 
 		 394 aa  89.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 421 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.12 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  21.8 
 
 		 685 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  28.81 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  22.69 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26513  MFS family transporter: multidrug efflux  26.94 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0853382  normal  0.0548675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  36.67 
 
 		 683 aa  70.1  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.85 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  31.43 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.85 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.23 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.65 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  27.13 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.03 
 
 		 577 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  26.44 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  26.44 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  26.73 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  26.73 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  26.44 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  26.73 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.11 
 
 		 657 aa  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  26.73 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  26.73 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.54 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.94 
 
 		 525 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  26.44 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  26.73 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  27.45 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  26.44 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  26.98 
 
 		 561 aa  64.3  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  26.73 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  26.73 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  26 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.86 
 
 		 532 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  30 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  27.89 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  27.74 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  27.99 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  27.99 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  27.99 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.59 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.11 
 
 		 543 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.95 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  29.9 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  20.69 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4168  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.55276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.57 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6161  Bcr/CflA family drug resistance transporter  32.2 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245445  normal  0.0414342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.31 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.73 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.503144  normal  0.675575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>