More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1203 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
410 aa  815    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  38.21 
 
 
410 aa  279  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  36.02 
 
 
404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
395 aa  263  6e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  37.11 
 
 
411 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  38.71 
 
 
404 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  38.46 
 
 
404 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  38.46 
 
 
404 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  38.46 
 
 
404 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  38.46 
 
 
404 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  38.46 
 
 
404 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  38.46 
 
 
404 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  35.62 
 
 
398 aa  256  6e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  37.97 
 
 
404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  39.27 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  35.45 
 
 
406 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 
397 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 
397 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  33.42 
 
 
411 aa  247  3e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  34.99 
 
 
408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  34.74 
 
 
408 aa  243  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 
408 aa  243  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  34.74 
 
 
408 aa  243  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  34.74 
 
 
408 aa  243  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  34.74 
 
 
408 aa  243  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  34.65 
 
 
409 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
399 aa  237  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 
413 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  32.82 
 
 
402 aa  236  6e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  35.52 
 
 
410 aa  235  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
413 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
406 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
397 aa  229  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  36.97 
 
 
404 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  36.97 
 
 
404 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  36.97 
 
 
404 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  36.97 
 
 
404 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 
403 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  38.04 
 
 
403 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  32.62 
 
 
406 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 
403 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  36.7 
 
 
404 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 
403 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  30.95 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  30.81 
 
 
409 aa  221  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  34.88 
 
 
405 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 
400 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  33.07 
 
 
431 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  33.51 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
423 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 
406 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  32.22 
 
 
407 aa  207  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.17 
 
 
416 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  30.95 
 
 
403 aa  202  8e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  31.25 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  29.16 
 
 
416 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  33.5 
 
 
415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 
407 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  30.4 
 
 
394 aa  196  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  29.87 
 
 
394 aa  195  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  31.05 
 
 
420 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  30.58 
 
 
411 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  34.77 
 
 
389 aa  172  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  30.73 
 
 
412 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
404 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  27.68 
 
 
401 aa  153  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  28.41 
 
 
407 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  32.15 
 
 
450 aa  129  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  24.33 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  24.33 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00877  multidrug resistance 1 transmembrane protein  25.36 
 
 
405 aa  96.7  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00243064  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.86 
 
 
440 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  22.96 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  23.94 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0180  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  25 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  25 
 
 
505 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.32 
 
 
506 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  25 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.19 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  25 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  23.98 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  23.98 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  23.54 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  23.54 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  25 
 
 
506 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  27.05 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  23.54 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  23.69 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  26.65 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.55 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.47 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.69 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  23.57 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  24.27 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1114  major facilitator transporter  21.32 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  23.85 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.28 
 
 
1833 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>