More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1882 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  82.4 
 
 		 408 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  82.4 
 
 		 408 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  82.19 
 
 		 409 aa  636    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  82.4 
 
 		 408 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  82.4 
 
 		 408 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  82.65 
 
 		 408 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  818    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  82.4 
 
 		 408 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  82.46 
 
 		 404 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  82.71 
 
 		 404 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  82.96 
 
 		 404 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  82.71 
 
 		 404 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  82.46 
 
 		 404 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  61.28 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  61.17 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  59.95 
 
 		 397 aa  474  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  59.39 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  59.31 
 
 		 410 aa  470  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  60.2 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  60.2 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  59.95 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  59.95 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  58.63 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 404 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  46.65 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  48.7 
 
 		 411 aa  363  4e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  48.95 
 
 		 403 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  43.21 
 
 		 405 aa  354  1e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  45.61 
 
 		 404 aa  345  8e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  44.91 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  44.91 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  44.91 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  44.91 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  44.91 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  44.91 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  44.91 
 
 		 404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  45.99 
 
 		 404 aa  342  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 407 aa  342  7e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  45.81 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  43.27 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 		 406 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 		 399 aa  331  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  42.57 
 
 		 409 aa  323  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 		 413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  42.24 
 
 		 487 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  41.04 
 
 		 413 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  41.52 
 
 		 406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  42.17 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  46.43 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 420 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  43.01 
 
 		 415 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 411 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 		 410 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 406 aa  239  8e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 		 407 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  33.85 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  34.11 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  33.98 
 
 		 401 aa  210  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 450 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  28.39 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 387 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.12 
 
 		 409 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  27.87 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  28.24 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  28.24 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  28.24 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.25 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.25 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  26.18 
 
 		 411 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  26.18 
 
 		 411 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 391 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  26.62 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  28.09 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.43 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  23.16 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>