More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2547 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  100 
 
 
408 aa  806    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
408 aa  806    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  90.32 
 
 
404 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  100 
 
 
408 aa  806    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  90.57 
 
 
404 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  806    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  99.75 
 
 
408 aa  806    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  99.76 
 
 
409 aa  777    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  82.4 
 
 
411 aa  662    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  90.57 
 
 
404 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  90.32 
 
 
404 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  100 
 
 
408 aa  806    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  90.07 
 
 
404 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  61.38 
 
 
397 aa  478  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  60.56 
 
 
410 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  59.34 
 
 
406 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  60 
 
 
397 aa  471  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  60.46 
 
 
397 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  60.1 
 
 
403 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  60.35 
 
 
403 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  60.35 
 
 
403 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  60.1 
 
 
403 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  61.52 
 
 
400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  47.97 
 
 
404 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  45.71 
 
 
410 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  44.23 
 
 
402 aa  369  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  48.24 
 
 
403 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  47.63 
 
 
411 aa  361  1e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  43.7 
 
 
405 aa  356  2.9999999999999997e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  45.96 
 
 
404 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  45.71 
 
 
404 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  45.71 
 
 
404 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  45.71 
 
 
404 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  45.71 
 
 
404 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  45.71 
 
 
404 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  45.96 
 
 
404 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  45.45 
 
 
404 aa  349  6e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  45.66 
 
 
404 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  42.97 
 
 
407 aa  342  7e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 
399 aa  332  9e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  45.81 
 
 
398 aa  331  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  42.45 
 
 
404 aa  330  3e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 
406 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  44.47 
 
 
409 aa  320  3e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  42.42 
 
 
406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  41.46 
 
 
431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  45.38 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  40.65 
 
 
487 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 
413 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.06 
 
 
416 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 
413 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  39.49 
 
 
416 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 
423 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  37.76 
 
 
420 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  42.19 
 
 
415 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  39.95 
 
 
411 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  39.06 
 
 
418 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 
410 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 
395 aa  236  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 
406 aa  229  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
407 aa  226  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  32.9 
 
 
401 aa  223  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  35.51 
 
 
394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  35.51 
 
 
394 aa  223  7e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  34.22 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  35.81 
 
 
407 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 
404 aa  199  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  28.2 
 
 
418 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  28.2 
 
 
418 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  32.22 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  24.28 
 
 
408 aa  89.7  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
415 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
392 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  29.23 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  24.83 
 
 
406 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.84 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  23.13 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.45 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.85 
 
 
428 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  24.83 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  24.83 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  23.69 
 
 
411 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  25.99 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  23.4 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  24.83 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  25 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  24.28 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.14 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.14 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.51 
 
 
511 aa  77  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  23.77 
 
 
400 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.29 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  23.6 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1277  major facilitator transporter  34.38 
 
 
437 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  24.69 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>