More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6161 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6161  Bcr/CflA family drug resistance transporter  100 
 
 
422 aa  830    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245445  normal  0.0414342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  69.68 
 
 
430 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  69.33 
 
 
444 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  68.19 
 
 
429 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  67.73 
 
 
428 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  36.14 
 
 
408 aa  206  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.34 
 
 
401 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2307  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.99 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1878  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.29 
 
 
397 aa  190  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.998766  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.71 
 
 
405 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.01 
 
 
405 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.11 
 
 
394 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0859  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34 
 
 
406 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194721  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2187  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  33.53 
 
 
406 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  32.45 
 
 
420 aa  173  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4471  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.38 
 
 
402 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.68 
 
 
392 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.06 
 
 
393 aa  167  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  35.6 
 
 
392 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  32.45 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  35.6 
 
 
392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.36 
 
 
420 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.19 
 
 
411 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.73 
 
 
401 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  32.36 
 
 
396 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0871  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.44 
 
 
404 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.56 
 
 
398 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.45 
 
 
398 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.96 
 
 
498 aa  160  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.75 
 
 
412 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.59 
 
 
396 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.59 
 
 
396 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  32.99 
 
 
426 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.88 
 
 
411 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2482  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.97 
 
 
405 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.07 
 
 
396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.6 
 
 
396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.6 
 
 
396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.6 
 
 
396 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.6 
 
 
396 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
413 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.36 
 
 
402 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.43 
 
 
393 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.35 
 
 
396 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  33.52 
 
 
393 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.52 
 
 
393 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.27 
 
 
402 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.71 
 
 
416 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.37 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.59 
 
 
396 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.59 
 
 
396 aa  154  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.59 
 
 
396 aa  154  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.59 
 
 
396 aa  154  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.59 
 
 
396 aa  154  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  31.59 
 
 
396 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  35.77 
 
 
414 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.81 
 
 
411 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3135  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.7 
 
 
415 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.08 
 
 
399 aa  153  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.08 
 
 
401 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  30 
 
 
399 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.16 
 
 
411 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.13 
 
 
407 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.33 
 
 
465 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  33.42 
 
 
392 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.07 
 
 
411 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.84 
 
 
393 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.6 
 
 
399 aa  149  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.72 
 
 
405 aa  149  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  31.78 
 
 
426 aa  149  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.42 
 
 
398 aa  149  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.21 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  33.72 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.97 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.03 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3647  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.43 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.72 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.95 
 
 
409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.7 
 
 
411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.15 
 
 
389 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  32.02 
 
 
404 aa  146  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1389  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.51 
 
 
387 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0010399  normal  0.0253639 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.45 
 
 
400 aa  145  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  28.54 
 
 
409 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.16 
 
 
396 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.54 
 
 
424 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.53 
 
 
425 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.22 
 
 
412 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5459  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.46 
 
 
389 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243673  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.6 
 
 
403 aa  143  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.26 
 
 
400 aa  143  5e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.51 
 
 
424 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.13 
 
 
424 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.29 
 
 
409 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.3 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.3 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.39 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  32.25 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  30.42 
 
 
407 aa  141  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.92 
 
 
409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>